兩稅合一的意義如下所示：
1.兩稅合一實現了四個統一。兩稅合一后，將實現四個統一：內資、外資企業(yè)適用同一的企業(yè)所得稅法;統一并降低企業(yè)所得稅稅率;統一和規(guī)范了稅前扣除辦法和標準;統一稅收優(yōu)惠政策，實行強調產業(yè)優(yōu)惠并兼顧區(qū)域優(yōu)惠的新稅收優(yōu)惠體系。四個統一有利于促進經濟增長方式轉變和產業(yè)結構升級，有利于提高我國利用外資的質量和水平，也有利于推動我國稅制的現代化建設和完善。
2.兩稅合一使內資企業(yè)和外資企業(yè)公平競爭。企業(yè)所得稅兩稅合并，對我們來說是期待已久振奮人心的好消息。不過由于歷史原因，企業(yè)所得稅在實際征繳過程中，有內緊外松的現象，可以說內資企業(yè)和外資企業(yè)是在不公平的起點上競爭。兩稅合一預示著內資企業(yè)將獲得公平競爭的機會，標志著我國市場經濟更趨于成熟。兩稅合一后，內資企業(yè)稅率的降低，會增加企業(yè)利潤，增強盈利能力，提高與外資企業(yè)的競爭力。
3.兩稅合一在一定程度上遏制了假外資和地方政府崇洋媚外的勢頭。假外資即經濟學上所謂的返程投資，指國內企業(yè)攜資本到國外注冊一家公司，進而由這家公司返回國內投資，從而享受包括稅收在內的各種外資優(yōu)惠政策。假投資雖然是內資企業(yè)求發(fā)展的無奈選擇，但卻有著相當的危害。大量返程投資企業(yè)未被納入境外投資管理體系，形成管理真空，影響了中國國際收支統計的質量。
